A colonoscopia visa examinar todo o intestino grosso (cólons e o reto) e, sempre que possível, a parte final do intestino delgado (íleo terminal). É um método bastante preciso que avalia todos os tipos de lesão com auxílio de uma microcâmera, uma lente de aumento e uma iluminação especial.

Quando identificadas lesões, a colonoscopia permite, na maioria das vezes, seu tratamento (como retirada de pólipos ou hemostasia de angioectasias) ou, se for o caso, colheita de material para estudo histopatológico (biópsias). Excepcionalmente, a progressão completa do aparelho pode ser impedida por alterações anatômicas, estreitamentos, aderências ou mesmo preparo intestinal inadequado.

É importante salientar que este exame é realizado sob sedação, não causando desta forma nenhum desconforto ao  paciente.